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陕西省血液中心白细胞研究室发现一例新的HLA不表达等位基因

时间：2021-09-10来源：陕西省血液中心作者：陕西省血液中心

        陕西省血液中心白细胞研究室把党史学习教育“我为群众办实事”和科研工作相结合，从业务难点入手，从实践中汲取奋斗的磅礴力量，深入探索，推动专业领域和延申科研的发展。
       HLA系统具有高度复杂的遗传多态性，不表达等位基因顾名思义虽然不表达蛋白产物，但它在移植免疫和组织相容性配型中却具有重要的意义。我国要求HLA高分辨分型实验室需要应用序列分析或血清学分型等实验室手段区分鉴定特定的或“经常发现”的不表达等位基因。为预警国内外移植配型领域，本次我实验室发现的不表达新等位基因HLA-C*03:560N已撰写专题报道于2021年6月发表于SCI期刊《HLA》。
       其先证者来自一位分子生物学完全缓解的造血干细胞移植潜在受者，我们在应用PCR-SBT、SSO等技术对其进行日常检测时发现HLA-C座位正反向序列中出现阶段性连续性杂合峰，经比对分析后初步定位到外显子4第679位碱基位置，由于该位置碱基T的缺失，引发下游密码子和阅读框架移位，最终导致在215位密码子提前终止，引起该等位基因的表达缺失。我们经Ion S5TM NGS技术再次确证后提交EMBL和IPD-IMGT/HLA数据库，于2021年3月30日被WHO HLA命名委员会正式授予命名HLA-C*03:560N (HWS10061495)，随后由本实验室提供的全外显子序列及相关信息被纳入最新的WHO命名报告中，这也是本实验室截至目前发现鉴定并被正式命名的第61例HLA新等位基因和第2例不表达等位基因。
       随着HLA等位基因数量的不断激增，其碱基序列呈现高度同源性，同时多种等位基因组合在测序区域内具有相同的杂合序列而导致的顺反式模棱两可，进一步造成检测区分难度增加，由此对实验室检测手段、人员技术水平和分析经验提出的要求也越来越高。我们针对发现的该例不表达等位基因，进一步利用生物信息学预测出该位置的碱基T缺失后的外显子序列内不存在新的剪切位点，符合不表达等位基因特征。
       无论对于造血干细胞移植的受者还是志愿捐献者，正确鉴定HLA不表达等位基因均关乎移植成败，若将不表达等位基因错判为表达的常见等位基因，则变“无”为“有”，将影响植活和移植后GVHD的发生。对于本例造血干细胞移植受者，我们给出了一份满意的答卷，为其顺利进入移植阶段保驾护航！用专业精神和不断探索未知的热情践行“我为群众办实事”。

             


 
 

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